1、 实时扣款：凡是签订“一户通”同城委托扣款协议的企业，在完成全申报以后，系统会自动提示是否要实时扣款。如果选择“是”则系统自动向银行发起扣款请求，并将扣款结果实时返回给企业，如果扣款成功，请于次日上网验证，如果扣款不成功，企业可以根据系统的提示进行相应的处理，也可以重新点击“全申报”以进行实时扣款。 
    2、 预约扣款：凡是签订“一户通”同城委托扣款协议的企业，在完成全申报以后，系统会自动提示是否要实时扣款。如果选择“否”则系统弹出一个窗口让企业选择一个扣款日期（该日期最迟为申报期限前的一天，不包括休息日），到了企业指定的日期，系统会自动向企业发起扣款请求，但是，由于一户通扣款涉及到税务、清算中心和各商业银行，环节较多，所以系统并不能保证所有的预约扣款都能成功，在 申报期限前务必上网验证扣款成功与否 ，以免产生不必要的麻烦。 
    3、 扣款失败：如果实时扣款失败，则自扣款失败之日起系统会自动向企业发起扣款请求，但是，和预约扣款一样，由于一户通扣款涉及到税务、清算中心和各商业银行，环节较多，系统并不能保证所有的扣款都能成功，所以在 申报期限前务必上网验证扣款成功与否 ，以免产生不必要的麻烦。 
    4、 对于预约扣款或扣款失败的企业，上网验证时扣款还未成功，企业可以重新点击“全申报”以进行实时扣款，或者到主管税务机关开票。 
    5、修改申报表：凡是签订“一户通”同城委托扣款协议并扣款成功的企业，如果在扣款成功的当天下午 4：30以前修改主申报表的，则系统会自动发起冲销请求（即取消上次扣款），冲销成功则允许修改主申报表，否则不允许修改主申报表。 企业在修改完主申报表后，必须重新进行全申报并扣款 。对于除主申报表之外的其他报表的修改，系统不做冲销，但是 修改完后务必重新进行全申报，否则会出现已扣款未全申报的现象。 凡是签订“一户通”同城委托扣款协议并扣款成功的企业，隔日后不允许修改主申报表，必须修改的，需提交各主管税务机关处理。